Shopify Payments vs Mollie: wat kies je als Belgische webshop?

Mollie vs Shopify Payments: op een Shopify-webshop is Shopify Payments bijna altijd goedkoper, omdat Shopify bovenop elke Mollie-transactie een toeslag van 0,2% tot 2% rekent. Mollie wint wel als je betaalmethodes nodig hebt die Shopify Payments niet heeft, op meerdere platformen verkoopt of Shopify Payments (nog) niet kunt gebruiken.

Beide zijn goede betaalproviders. De juiste keuze hangt af van je Shopify-plan, je gemiddelde orderwaarde en de betaalmethodes van je klanten. We rekenen het hieronder door met de regels die Shopify zelf hanteert. Het grotere plaatje staat in onze gids over Shopify betalingen in België en Nederland.

Wat is het verschil tussen Mollie en Shopify Payments?

Shopify Payments is de ingebouwde betaaloplossing van Shopify, met Stripe als verwerker achter de schermen. Je activeert hem in je admin en ziet uitbetalingen en chargebacks naast je orders. Mollie is een onafhankelijke payment provider uit Amsterdam die ook werkt met WooCommerce, Magento en maatwerk. Op Shopify koppel je Mollie met een aparte app per betaalmethode.

De tarieven per methode liggen dicht bij elkaar. Het grootste verschil zit in hoe Shopify omgaat met providers die niet van Shopify zelf zijn.

Mollie vs Shopify Payments: de tarieven naast elkaar

Dit zijn de publieke standaardtarieven voor online betalingen in België (nagekeken in oktober 2026). Onderhandelde volumetarieven vallen erbuiten.

Op kaarten is Mollie goedkoper dan Shopify Payments op Basic, gelijk aan Grow en duurder dan Advanced en Plus. Op Bancontact en iDEAL | Wero liggen de vaste bedragen bijna gelijk. Let wel op het land van je Mollie-account: met een Nederlands account betaal je voor Bancontact 1,40% + EUR 0,25. Bij een order van EUR 80 is dat EUR 1,37 in plaats van EUR 0,39.

Alle tarieven per plan, met rekenvoorbeelden, vind je in Shopify Payments kosten en tarieven. Stap je over, dan helpt onze handleiding Shopify Payments instellen in België.

De Shopify-toeslag maakt het verschil

Gebruik je op Shopify een andere provider dan Shopify Payments, dan rekent Shopify een toeslag bovenop wat die provider vraagt: 2% op Basic, 1% op Grow, 0,6% op Advanced en 0,2% op Plus. Shopify berekent die op de volledige orderwaarde, inclusief btw en verzending, en betaalt hem niet terug bij een refund.

Shopify Payments, Shop Pay, manuele methodes zoals overschrijving en POS-orders zijn vrijgesteld. PayPal ook, maar alleen als Shopify Payments je primaire provider is. Bancontact, iDEAL of Klarna via Mollie staan niet op die lijst: de regel geldt voor elke transactie via een externe provider.

Rekenvoorbeeld: wat kost Mollie op Shopify echt?

Een Belgische webshop op het Grow-plan krijgt 1.000 bestellingen per maand van gemiddeld EUR 80, samen EUR 80.000 omzet. 60% betaalt met Bancontact, 30% met een Europese consumentenkaart en 10% met Klarna.

Zonder toeslag zouden beide bijna even duur zijn: EUR 1.015 tegenover EUR 1.025. Met de toeslag betaal je met Mollie EUR 810 per maand meer, bijna EUR 9.720 per jaar. Op Basic is het verschil groter, op Plus kleiner.

Ook voor een kleine winkel speelt het. In onze simulator kost een winkel op Basic met 110 orders van EUR 100 en de gemiddelde Belgische betaalmix met Shopify Payments EUR 2.556 per jaar en met Mollie EUR 5.142, waarvan EUR 2.640 Shopify-toeslag. Reken hieronder je eigen mix door.

Waar Mollie wint

Meer betaalmethodes voor de Benelux. Via Mollie bied je in3, Riverty, Billink, de KBC/CBC- en Belfius-betaalknop, SEPA-overschrijving en Belgische maaltijd- en ecocheques aan. Die zitten niet in Shopify Payments.

Eén provider voor meerdere platformen. Verkoop je ook via WooCommerce, maatwerk of een boekingssysteem, dan houd je met Mollie één contract, één dashboard en één uitbetaling.

Als Shopify Payments (nog) niet kan. Shopify Payments vraagt een bedrijf en rekening in een ondersteund land en keurt niet elke sector goed. Voor iDEAL | Wero beoordeelt Shopify eerst of je winkel in aanmerking komt. De onboarding bij Mollie gaat snel.

Je neemt het mee. Verhuis je later weg van Shopify, dan blijft je Mollie-account bruikbaar.

Onderhandelde tarieven. Mollie geeft volumekortingen op aanvraag. Bij grote volumes op Plus, waar de toeslag maar 0,2% is, kan dat de rekensom kantelen. Reken dan beide door met je echte cijfers.

Waar Shopify Payments wint

Geen toeslag. In de meeste rekenvoorbeelden is dat het grootste verschil.

Alles in Shopify. Uitbetalingen, refunds, chargebacks en fraudeanalyse zie je in je Shopify-admin. Met Mollie beheer je het geld en je bankrekening in het Mollie-dashboard.

Snelle checkouts. Shop Pay, Apple Pay en Google Pay staan automatisch aan.

PayPal zonder toeslag. Dat geldt zolang Shopify Payments je primaire provider is.

Lagere tarieven op hogere plannen. Op Advanced en Plus zijn de kaarttarieven lager dan het standaardtarief van Mollie. Op Shopify Plus daalt Bancontact naar EUR 0,29 en iDEAL | Wero naar EUR 0,15.

Lock-in: hoe vast zit je?

Shopify Payments werkt alleen op Shopify. Verhuis je naar een ander platform, dan zoek je een nieuwe provider. Mollie is platformonafhankelijk: je account, historiek en uitbetalingen blijven bij een platformwissel.

Het echte risico zit in opgeslagen kaarten en abonnementen. Bewaarde betaalgegevens horen bij de provider die ze verwerkt. Bij een overstap moet je die laten migreren of je klanten opnieuw laten betalen. Plan dat apart als je met abonnementen werkt.

Kun je Shopify Payments en Mollie samen gebruiken?

Ja, op twee manieren, en allebei met een prijs.

Shopify Payments primair, Mollie voor één extra methode

Je houdt Shopify Payments voor kaarten, Bancontact, iDEAL | Wero en Klarna, en installeert één Mollie-app voor een methode die Shopify Payments niet heeft, zoals in3. Op die transacties betaal je het Mollie-tarief plus de toeslag. Een in3-order van EUR 80 op Grow kost zo 3,99% + EUR 0,95 (EUR 4,14) plus 1% toeslag (EUR 0,80), samen EUR 4,94.

Mollie voor kaarten, Shopify Payments ernaast

Shopify laat maximaal één directe externe provider naast Shopify Payments toe. Verwerkt Mollie de kaarten, met toeslag, dan lopen Shop Pay en de lokale methodes via Shopify Payments aan het standaardtarief plus 1,25%. In ons voorbeeld van 1.000 orders kost dat ongeveer EUR 1.955 per maand: duurder dan beide andere opties. Plus-merchants met een getekend contract kunnen deze combinatie niet gebruiken.

Je kunt maar één kaartprovider tegelijk hebben. Activeer je kaarten via Mollie, dan verwerkt Shopify Payments geen kaarten meer.

Zo koppel je Mollie aan Shopify

Maak een Mollie-account aan en laat het verifiëren.

Activeer in het Mollie-dashboard de betaalmethodes op het juiste websiteprofiel.

Zoek in de Shopify App Store per methode de Mollie-app, bijvoorbeeld Mollie Bancontact of Mollie in3. Mollie raadt een aparte app per methode aan, zodat klanten ze los zien in de checkout.

Kies Install app en daarna Connect via Mollie. Je hebt de rol van eigenaar nodig in Shopify en in Mollie.

Kies je websiteprofiel en activeer.

Doe per methode een testbestelling en controleer een refund vanuit Shopify.

Verwijder een oude Mollie-app niet zomaar: volgens Mollie kun je dan oudere betalingen niet meer terugbetalen. Deactiveren is veilig. Mollie-methodes rekenen betalingen ook meteen af, ook als je winkel op manuele capture staat. Bij Klarna en andere vormen van achteraf betalen volgt de afrekening wel je instellingen in Shopify.

Mollie of Shopify Payments: de beslisgids

Mag je product op Shopify Payments? Bij cannabisgerelateerde producten, tabak, gokken, adult of crypto vaak niet. Dan kies je Mollie of een andere provider.

Verkoop je op meerdere platformen en wil je één provider? Dan is Mollie logisch. Reken de toeslag op je Shopify-omzet mee.

Is Shopify Payments nog niet actief voor je winkel? Start dan tijdelijk met Mollie en plan de overstap.

Heb je een methode nodig die Shopify Payments niet heeft? Denk aan in3, Riverty of een betaalknop. Houd Shopify Payments primair en voeg één Mollie-app toe.

Zit je op Plus met een onderhandeld Mollie-tarief? Reken beide door met je echte cijfers.

Geen van bovenstaande? Kies Shopify Payments.

Bij onze klanten wegen vier dingen het zwaarst: welke methodes je klanten verwachten, de kosten, de gewoontes in je team en de koppeling met je boekhouding. Voor kleinere bedrijven gaat het om centen per order. Bij grote merchants loopt het verschil tussen providers snel op tot EUR 10.000 per maand.

Betaalkosten zijn maar één deel van je budget. Bekijk ook wat een Shopify-webshop in totaal kost.

Wat we leerden in de Shopify Community

Klarna via Mollie kreeg 2% extra. Een Nederlandse merchant zag bovenop het Klarna-tarief van Mollie een toeslag van 2% van Shopify. Dat klopt: de toeslag geldt voor elke externe provider. Klarna zit intussen in Shopify Payments voor België en Nederland, dus voor Klarna is dat probleem verouderd. Onze kijk: achteraf betalen is voor veel van onze klanten minder relevant, zeker bij hoge tickets, omdat de procentuele fee snel oploopt. Bron: Shopify Community, september 2023.

iDEAL niet beschikbaar voor een nieuwe winkel. Een merchant kreeg iDEAL via Shopify Payments niet geactiveerd en koppelde Mollie, waarna iDEAL meteen werkte. Latere reacties wijzen op de toeslag van 2% op Basic. Een vaste drempel van 100 orders, waar sommigen over spreken, bevestigt Shopify niet. Bron: Shopify Community, september 2025.

Bancontact verdween uit de checkout. Een Belgische winkel zag Bancontact via Shopify Payments een week voor de lancering verdwijnen. Support stelde Mollie voor als tijdelijke vervanger; in de thread is het onopgelost. Onze kijk: een standaard back-up-provider zetten we niet klaar. Wel zorgen we altijd voor meer dan één betaalmethode. Bron: Shopify Community, augustus 2024.

Het geld van Mollie Bancontact loopt buiten Shopify. Een Belgische merchant vond in Shopify geen plek om de bankrekening voor Mollie Bancontact te wijzigen. Shopify verwees naar Mollie: dat geld beheer je in het Mollie-dashboard. Bron: Shopify Community, juni 2024.

Hoe 6th Man hierbij helpt

We zetten zowel Shopify Payments als Mollie op, dus we hebben geen belang bij de ene of de andere. We rekenen je echte betaalmix door, zeggen het eerlijk als Mollie beter past en zetten de gekozen opstelling op, inclusief testen en refunds. Start met onze payment simulator voor e-commerce managers en bespreek de uitkomst met ons.